第二十二章 锌指帝国
电塔喀挼生物技术有限公司,请问有什么可以帮到您的吗?”
“啊,我找高经理。”
“好的,请问您贵姓。”
“卢。”
“好的,这就帮您转接。”
“卢先生您好,请问是又有什么采购需求了吗?”
“老高啊,我问你个事儿。你们公司能代组锌指吗?”
“抱歉了哈,我们没有这个产品。”
“那你们同行,或者上游厂家有没有啊帮我打听一下。”
“没有。”
“怎么这么肯定?”
“说实话,圣加蒙那专利刚过期的时候,我们就想仿了,但是没仿出来,就不了了之了。”
“怎么回事?是有什么技术上的难点吗?”
电话那头的人忽然压低了声音,“我跟你说了你可别瞎传啊。我们研发部门,一步一步照着专利做,过程极其顺利,可是一测效率就是百分之零。我们隔壁那几个厂也都是这样。说实话,我们都怀疑他们那专利有问题,按理说不可能复现不了的。”
“啊?”卢赫一时间消化不了。
“哎呀,就是这样。您是我们老客户了,才跟您说这么多。不过没有锌指也无所谓,我们这边建议您还是用CRISPR吧,又简单效率又高。没必要去死磕那种20年前的老古董。”
“好吧,谢了啊老高。”
“不客气不客气,有什么需要尽管联系我。”
卢哥挂掉电话,扯掉浴巾,又开始挠头,“专利还能有假?真当审查员是吃白饭的吗?”
“就是!”菜菜也不屑地说,“三个碱基对应一个氨基酸,DNA就只有四种碱基,理论上只有64种氨基酸序列,也就区区64种锌指来回组合,DNA的GPS不就有了吗?这有什么难的啊?”
卢赫听后不可思议地吸了一口凉气,摇着头拉过一把椅子,示意菜菜坐下。他满脸慈爱地看着眼前这个头脑和四肢都简单只有10根手指头发达的傻姑娘,说:“来,让为师考考你,你先说说,什么是锌指技术?”
菜菜一脸你绝对考不住我地回答道:“首先,根据‘中心法则’,基因组DNA通过转录和翻译两个步骤知道蛋白质生产。其中,转录指基于DNA模板的RNA合成,翻译指基于RNA模板的蛋白质合成,进而决定了我们的性状。”
“你曾经的偶像罗伯特·里德还发现,在RNA的合成过程种,有一种聚合酶起了关键作用。它就像生产流水线上的装配工人,根据包工头DNA提供的图纸,一个碱基、一个碱基地组装连接成RNA长链。”
“其次,里德还发现,RNA的生产过程中,除了DNA、RNA聚合酶和碱基原料以外,还存在一个叫做TFIIIA的转录因子。它就像一个指挥官,告诉RNA聚合酶从DNA图纸的哪里开始组装。这就解释了为什么所有体细胞都共享一个基因组,但血红蛋白只能在红细胞内合成,胰岛素只能在胰岛β细胞中生产。”
“最后,艾伦·克鲁格发现,TFIIIA之所以可以特异性结合DNA,是因为它有个DNA识别模块。其中数十个氨基酸围绕在游离的锌离子周边,形成一个像手指一样的立体结构,这就是锌指。”
“很好。”卢赫连连点头,“然后呢?”
“然后?然后不就是一个锌手指能够识别三个碱基序列,把多个锌手指组合在一起,连接上核酸内切酶,不就能完成特异性识别并且咔嚓一下子剪断DNA了嘛?”
菜菜说完得意地眨着眼睛望着卢赫,好像在说:快表扬我。
“没了?”卢赫追问道。
“没啦呀。3个碱基表征一个氨基酸,理论上氨基酸也就只有64种,找到对应的64个锌手指,排列组合在一起,实现对靶标基因的精确定位。”
“唉。。。”卢赫叹气道,“姑娘你还是太年轻。言之易,行之难。我之前总跟你说锌指组装起来很难你知道为什么吗?”
“对呀!为什么呀?按原理来看,组装锌指不就是有手就能干的事嘛?”
“因为锌指之间是会互相干扰的。比如,你想要组一个能特异性识别GGTAAGATC的锌指。你以为是把GGT、AAG、ATC对应的三个锌指粘起来就行了吗?不是的。锌指之间会互相干扰,GGT的锌指会稍微摸到AGG的A一点,同样ATC的锌指也会暗戳戳地碰一下AGG的G,反之亦然。这相当于有效的识别序列被模糊成了GGNNANNTC,使特异性结合的能力大大下降,脱靶能脱到姥姥家去。”
菜菜听后蹙起眉头,嘟着嘴默默沉思。
“不过克鲁格找到了一个十分‘优雅’的方式,解决了这个问题。每一个3碱基序列都有可能对应多个锌手指,早在30年前就积累出大几百个了,总能找到两个能和谐共处的锌指。对于GGTAAGATC来说,可以先找到和谐相处的GGT-AAG(A),再找到和谐相处的AAG(B)-ATC,最终再搜寻出一个AAG(C)使它和AAG(A)、AAG(B)结构类似,问题就解决了。”
“通过6个人就能认识全世界?”菜菜惊叹道。